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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

《“9·5”泸定地震灾后恢复重建景区恢复和产业发展专项实施方案》出炉******

　　中新网成都1月9日电 (记者 王鹏)记者9日从四川省人民政府官方网站获悉，四川省政府办公厅近日正式印发《“9·5”泸定地震灾后恢复重建景区恢复和产业发展专项实施方案》(下称《实施方案》)。

　　《实施方案》提出，充分借鉴汶川、芦山、九寨沟等地震灾后恢复重建的成功经验，以重点景区恢复重建为关键，以推动灾区文化旅游业同特色农业、绿色工业、商贸流通业和民族文化保护传承的互动融合为主线，力争通过地震灾后恢复重建，提升旅游景区发展水平，打造大贡嘎世界山地度假旅游目的地，推进环贡嘎区域旅游整体提升，民族地区经济社会全面发展，重建幸福美丽新家园。

　　根据《实施方案》，以海螺沟和王岗坪景区恢复提升为重点，重点开展景区生态环境修复、旅游交通设施恢复、旅游服务设施恢复、旅游品质提升等，高质量打造大贡嘎世界山地度假旅游目的地。

　　其中，力争海螺沟景区“一年局部开放，二年全面恢复，三年实现提升”，将磨西—燕子沟打造成为世界知名旅游镇；王岗坪景区“半年局部开放、一年完全开放、三年完成提升”，打造世界级原始森林原生态体验旅游目的地。用三年时间基本完成灾后恢复重建任务，初步建成品牌形象鲜明、产品业态丰富、产业素质高、服务功能完善、主客和谐共享的国家级灾后文化旅游恢复重建示范区。

　　《实施方案》指出，力争通过三年努力，灾区工业全面恢复振兴，产业结构进一步优化，特色产业规模进一步壮大，集中集群集约发展水平进一步提升，重点企业竞争力进一步增强，特色鲜明、绿色生态的工业体系初步建成。

　　此外，还将有序拓展新的旅游区域，协同推动牛背山、田湾河、喇叭河、汉源湖、伍须海、莲花湖、铧尖山、娘娘山等旅游景区开发，建设喇叭河镇大熊猫国家公园生态体验区，丰富景区文化内涵和生态价值。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）